指定時間からカウント

１時間からスタートの場合
1時間は3600秒

final Chronometer chronometer2 = (Chronometer) findViewById(R.id.chronometer2);

long time2 = SystemClock.elapsedRealtime() - 3600*1000;

chronometer2.setBase(time2);
chronometer2.start();

time2　の値はマイナスになっても大丈夫な様だ。